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153 Research products, page 1 of 16

  • European Marine Science
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  • Open Access
  • CemOA
  • Mémoires en Sciences de l'Information et de la Communication
  • Hal-Diderot

10
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  • Open Access English
    Authors: 
    Labadie, P.; Blasi, C.; Le Menach, K.; Geneste, E.; Babut, M.; Perceval, O.; Budzinski, H.;

    Chlorinated paraffins (CPs) are high-volume chemicals used in numerous industrial applications. Their quantitative analysis is extremely challenging and this work presents the optimization of an analytical method based on gas chromatography hyphenated with electron capture negative ionization time-offlight high-resolution mass spectrometry (GC-ECNI-TOF HRMS) for the simultaneous determination of short-chain and medium-chain CPs (SCCPs and MCCPs, respectively) in fish tissues (i.e. dorsal muscle). The resolution of the TOF-MS analyzer reduced or eliminated isobaric interferences and the CP response was optimized through Design of Experiment. A simple clean-up procedure based on adsorption chromatography further removed some potentially interfering organochlorines. Good selectivity, linearity and accuracy were achieved; method detection limits or limits of reporting were compatible with expected levels in wild fish (0.03-0.35 ng g-1 wet weight, ww, depending on the congener). This method was proven suitable for the analysis of CPs in tissues of common barbel Barbus, a fish species frequently used for water quality monitoring purposes in Europe. SCCPs and MCCPs were found to be widespread within the Rhône river basin (France). At all locations, MCCP concentrations (1.3-72.7 ng g-1 ww) were higher than those of SCCPs (0.3-10.6 ng g-1 ww) and levels were systematically lower than the proposed Probable No Effect Concentrations (PNEC). Spatial variations of SCCP composition profiles largely surpassed those of MCCPs, suggesting the influence of local sources.

  • Open Access French
    Authors: 
    Daupagne, L.; Rolan-Meynard, M.; Dublon, J.; Argillier, C.;

    / Une enquête nationale a été lancée pour améliorer nos connaissances des pratiques de gestion piscicole en milieux lacustres afin de mieux comprendre, à terme, le rôle de cette gestion dans la structure des peuplements observés. Ces résultats révèlent le dynamisme des structures de gestion, qu'il s'agisse des Fédérations ou des Associations de pêche, soucieuses à la fois de satisfaire les pêcheurs et de préserver ou améliorer la qualité des milieux aquatiques lentiques. Ces structures interviennent sur un grand nombre de sites, de différentes taille et origine, et mettent en oeuvre diverses actions sur les peuplements et les milieux. Les pratiques de gestion, différentes selon le type de milieu considéré, semblent toutefois avoir assez peu évolué, les déversements d'espèces demeurent l'action de gestion la plus fréquente et les espèces manipulées sont les mêmes qu'il y a 20 ans. Néanmoins, il semblerait qu'une évolution des pratiques soit en marche, l'idée d'un passage à une gestion patrimoniale, bien que très marginale aujourd'hui, semblant peu à peu faire son chemin. Malgré l'amélioration des connaissances sur les plans d'eau liée à la mise en place des réseaux de surveillance ou de contrôle opérationnel prévus par la DCE, les gestionnaires semblent toujours confrontés à un manque de connaissances qui porte préjudice à la gestion. Des inventaires supplémentaires, des études ainsi que des suivis de prélèvements sont directement entrepris par ces derniers, sans que cela ne se traduise toutefois par la prise de mesure particulière. Cela suggère une difficulté dans la traduction opérationnelle des informations collectées.

  • Open Access English
    Authors: 
    Favier, V.; Agosta, C.; Parouty, S.; Durand, G.; Delaygue, G.; Gallee, H.; Drouet, A.S.; Trouvilliez, A.; Krinner, G.;
    Project: EC | ICE2SEA (226375)

    We present an updated and quality controlled surface mass balance (SMB) database for the Antarctic ice sheet. Importantly, the database includes formatted metadata, such as measurement technique, elevation, time covered, etc, which allows any user to filter out the data. Here, we discard data with limited spatial and temporal representativeness, too small measurement accuracy, or lack of quality control. Applied to the database, this filtering process gives four times more reliable data than when applied to previously available databases. New data with high spatial resolution are now available over long traverses, and at low elevation in some areas. However, the quality control led to a considerable reduction in the spatial density of data in several regions, particularly over West Antarctica. Over interior plateaus, where the SMB is low, the spatial density of measurements remains high. This quality controlled dataset was compared to results from ERA-Interim reanalysis to assess whether field data allow us to reconstruct an accurate description of the main SMB distribution features in Antarctica. We identified large areas where data gaps impede model validation: except for very few areas (e. g., Adelie Land), measurements in the elevation range between 200 m and 1000 m above sea level are not regularly distributed and do not allow a thorough validation of models in such regions with complex topography, where the highest scattering of SMB values is reported. Clearly, increasing the spatial density of field measurements at low elevations, in the Antarctic Peninsula and in West Antarctica is a scientific priority.

  • Open Access French
    Authors: 
    Le Pichon, C.; Tales, E.;

    Diagnosing impacts of streams fragmentation on fish is crucial in order to efficiently restore ecological continuity and to make blue infrastructure functional again. Using biotelemetry tools is a method to determine if fish could pass obstacles (e.g. dams, weirs) occurring across streams and finally assess restoration efficacy. A case study is presented concerning survey of brown trout populations inhabiting fragmented small headwater streams in Ile de France region. / Pour que la trame bleue soit fonctionnelle, il est important de diagnostiquer l'effet de la fragmentation des cours d'eau sur les poissons pour restaurer de manière efficace la continuité écologique. Une méthode consiste à utiliser les outils de biotélémétrie pour identifier la capacité des poissons à franchir les ouvrages existants et leurs aménagements et évaluer ainsi l'efficacité de la restauration. Un cas d'étude est présenté concernant le suivi de populations de truite dans des petits cours d'eau de têtes de bassins en Ile-de-France.

  • Open Access French
    Authors: 
    Le Pichon, C.; Alp, M.;

    / Compte tenu de l'effort d'amélioration de la continuité écologique dans le bassin de la Seine, il s'avère important d'essayer de quantifier les conséquences de différents scenarios d'aménagements de l'estuaire pour les poissons estuariens et migrateurs. Dans ce contexte, le projet ANACONDHA s'intéresse à la connectivité fonctionnelle de l'estuaire de la Seine et à la capacité des différentes espèces de poissons d'y réaliser une partie ou l'ensemble de leur cycle de vie. Les objectifs sont (1) de tester une approche de modélisation géomatique de la connectivité fonctionnelle et (2) d'évaluer sa capacité à fournir une analyse cartographique des potentialités de préservation et de réhabilitation des habitats estuariens. Après un bilan bibliographique et une consultation de 15 experts comptant des chercheurs, des acteurs régionaux et des acteurs locaux, 6 espèces avec des cycles de vie contrastés et présentant des enjeux différents au sein de l'estuaire ont été sélectionnées comme candidates pour modéliser la connectivité fonctionnelle : le bar commun, la truite de mer, l'anguille européenne, le mulet porc, le flet et la brème commune. Considérant la disponibilité des données géomatiques, la liste des espèces candidates et les avis des experts en termes des priorités régionales, le choix a été fait de se concentrer dans les modélisations sur deux cas d'étude contrastés : 1) les migrations tidales des juvéniles du bar commun vers les nourriceries et les habitats de refuge au cours d'une marée et 2) les migrations des adultes de truite commune (forme rivière et mer) vers les frayères. Ces choix ont permis de tester l'approche de modélisation géomatique de la connectivité (outil ANAQUALAND) sur des cas qui impliquent des étendues spatiales (embouchure versus tout l'estuaire avec les affluents) et des échelles temporelles (un cycle de la marée versus une période de plusieurs mois) très différentes. Le travail réalisé offre une ouverture importante sur le sujet avec la possibilité d'aborder des questions concernant les traits biologiques des espèces en lien avec leur mobilité et de tester des hypothèses qui sont difficilement testables expérimentalement sur de grands milieux dynamiques comme l'estuaire de la Seine.

  • Open Access French
    Authors: 
    Lepage, M.; Bons, S.; Lefevbre, G.; Le Barh, R.; Teichert, N.; Carassou, L.; Pierre, M.;

    / Le contrôle de surveillance doit permettre de récolter les données nécessaires pour évaluer l'état écologique de chaque masse d'eau sélectionnée, via l'utilisation de métriques basées sur le peuplement de poisson, en lui attribuant une note de qualité. La réalisation récurrente de ce contrôle standardisé doit également permettre d'interpréter les modifications et évolutions de ces peuplements résultant d'incidences naturelles et/ou anthropiques. Les résultats du contrôle de surveillance serviront ensuite au rapportage européen en 2015. Ce rapport présente, les résultats des campagnes de contrôle de surveillance 2016, une description de la méthodologie et des premiers résultats des campagnes.

  • Open Access English
    Authors: 
    Lechêne, A.; Lobry, J.; Boët, P.; Laffaille, P.;

    Functional trait theory provides a mechanistic framework to understand change in community composition and community assembly through time and space. Despite this, trait-based approaches have seldom been used in ecological restoration. Succession theory predicts that habitat complexity and resource availability will increase with restoration time, leading to increased functional dissimilarity among coexisting species. However, in the case of tidal marsh restoration, it is not clear whether reestablishing the harsh abiotic conditions typical of estuaries will initiate successional trajectories. We investigated monotonic changes in the functional structure of fish communities and shifts in assembly mechanisms, with tidal restoration time. A five-level gradient of 'intertidal habitat naturalness' was constructed from a set of artificialized (dyked), restored (with different ages) and natural intertidal sites, and used as a surrogate for restoration progress. The fish ecophases were described using ten functional traits related to food acquisition and swimming ability. The trends in six functional dimensions (identity, richness, evenness, dispersion, originality and specialization) were investigated along the naturalness gradient. Consistenly with succession theory, functional specialization, dispersion and, less markedly, richness increased with intertidal naturalness meaning that restored and natural intertidal habitats supplied fish with specific foraging and dwelling conditions absent from dyked marshes. Community assembly patterns varied with respect to traits and differed at both ends of the naturalness gradient. Dyked marshes were more affected by trait convergence possibly due to limiting resources. Environmental filtering was detected all along the naturalness gradient although the traits affected varied depending on the naturalness level of habitats. Environmental filtering tended to decrease in restored and natural intertidal habitats. Increased naturalness restored the attractivity of benthic habitats as feeding or settling grounds, promoted shelter-seeking vs. free-swimming strategists and favoured ecophases with carnivorous diets, feeding on microinvertebrates and benthic low-mobility macroinvertebrates. Approaches based on functional trait diversity have the potential to question and refine the theoretical frame of ecological restoration and to assist managers in their efforts to restore tidal wetlands.test

  • Open Access English
    Authors: 
    Abdel Malak, I.; Cariou, R.; Venisseau, A.; Dervilly Pinel, G.; Jaber, F.; Babut, M.; Le Bizec, B.;

    Dechlorane related compounds (DRCs), including Dechlorane Plus (syn-DP and anti-DP), Dechlorane-601,-602, -603 and Chlordene Plus (CP), constitute a group of polychlorinated flame retardants (FRs) that are still of industrial use. In particular, DRCs have been detected in various nvironmental matrices and in different aquatic and terrestrial biota, thus exhibiting bioaccumulation and biomagnification potentials. The present study aimed at producing first occurrence data of a range of DRCs in Silurus spp. samples from different rivers located in France. Determination was carried out by gas chromatography high-resolution mass spectrometry after a sample clean-up based on a multilayer silica column and gel permeation chromatography. The concentration of monitored SDRCs ranged from 1.58 to 408 pg.g-1 wet weight (54 - 11100 pg.g-1 lipid weight). The fractional abundance of syn- and anti-DP stereoisomers was similar to that reported by other studies with an average equal to 0.60. Dec-601 was not detected in any sample. Detection frequencies ranged between 34 and 100% for other DRCs. Investigated correlations between DRCs and polychlorobiphenyls (PCBs) suggest a link with lipid content but independent contamination sources.

  • Open Access English
    Authors: 
    Le Coarer, Y.; Testi, B.; Beguin, J.;

    Hydropeaking flow fluctuations can affect aquatic fauna in various ways, depending on the river's morphological characteristics. We have developed a method for quantifying hydropeaking events by drawing up hydrosignatures. In a given flow, a hydrosignature quantifies the hydraulic diversity in any area/part of the aquatic space defined by either volume or area percentages on a depth and current velocity cross grid. When a two-dimensional hydraulic model for hydropeaking events is available, in a given reach, a comparative hydrosignature index can be calculated between the hydrosignature of the present time step and the initial hydrosignature, or between two hydrosignatures separated by a constant time interval. This method is useful to determine where major changes have occurred along a river, and to classify hydropeaking intensities. This approach can be used to analyse the level of hydraulic transformation of an entire reach but does not focus on the sides of the channel inhabited by the juvenile fish, which are particularly exposed to the effects of flow fluctuations. Juvenile habitats can be defined by suitability indexes which are attributed to hydraulic classes of hydrosignatures. The total weighted usable area of a juvenile habitat can be calculated at all the time steps in a hydraulic simulation by partitioning any hydraulic mesh into hydraulic classes. An index quantifying the damage to juvenile populations can then be defined by calculating the maximum change in habitat area observed during the hydropeaking event. / Selon la morphologie d'un cours d'eau, une même variation de débit suite à une éclusée peut avoir des conséquences diverses sur les communautés aquatiques en place. C'est pourquoi, nous proposons une méthode pour quantifier l'effet des éclusées à l'aide d'hydrosignatures. À un débit donné, pour une partie de l'espace aquatique, une hydrosignature quantifie la diversité hydraulique comme la répartition en pourcentages d'aires ou de volumes de verticales hydrauliques reparties dans des classes croisées de vitesses moyennes et de hauteurs d'eau. Lorsque l'on dispose d'une modélisation hydraulique bidimensionnelle d'un tronçon de rivière en éclusées, celui-ci peut être analysé en sous-tronçons de longueurs fixes, en utilisant un système de repérage en coordonnées curvilignes. Pour tout sous-tronçon, un indice de comparaison d'hydrosignatures, peut être calculé entre un pas de temps donné et l'instant initial ou entre deux instants séparés par une durée fixée. Cette méthode permet de localiser les parties d'un cours d'eau où les variations hydrauliques sont les plus importantes, mais aussi de classifier des intensités de variations hydrauliques entre cours d'eau soumis à des éclusées. Cependant, si cette approche permet de qualifier l'entièreté d'un chenal, elle ne permet pas d'analyser spécifiquement les variations hydrauliques en bordures, là où les jeunes stades de poissons sont particulièrement mis en danger par les variations hydrauliques locales. Cet habitat spécifique peut être défini par des coefficients de préférences pour des classes hydrauliques. Ces coefficients peuvent être calculés d'une façon similaire à la construction des courbes de préférences classiques à partir d'hydrosignatures d'échantillonnages par pêches électriques. Pour un tronçon de cours d'eau, l'aire pondérée utile de cet habitat peut être calculée pour chaque pas de temps d'une simulation hydraulique d'éclusée. Ces calculs sont effectués en partitionnant les mailles hydrauliques en sous-mailles n'appartenant qu'à une classe hydraulique. Un indice qualifiant le risque pour les jeunes stades de poissons peut être défini comme le maximum de variation de surface pondérée lors de l'éclusée.

  • Open Access English
    Authors: 
    Roubeix, V.; Daufresne, M.; Argillier, C.; Dublon, J.; Maire, A.; Nicolas, D.; Raymond, J.C.; Danis, P.A.;

    The management of lakes requires the definition of physico-chemical thresholds to be used for ecosystem preservation or restoration. According to the European Water Framework Directive, the limits between physico-chemical quality classes must be set consistently with biological quality elements. One wayto dothis consists in analyzing the response of aquatic communitiesto environmental gradients across monitoring sites and in identifying ecological community thresholds, i.e. zones in the gradients where the species turnover is the highest. In this study, fish data from 196 lakes in France were considered to derive ecological thresholds using the multivariate method of gradient forest. The analysis was performed on 25 species and 36 environmental parameters. The results revealed the highest importance of maximal water temperature in the distribution offish species. Otherimportant parametersincluded geographical factors, dissolved organic carbon concentration and watertransparency, while nutrients appearedto havelowinfluence. In spite ofthe diversity of species responses to the gradients, community thresholds were detected in the gradients of the most important physico-chemical parameters and of total phosphorus and nitrate concentrations as well. The thresholds identifiedin such macroecological studymay highlight new patterns of species natural distribution andimprove niche characterization. Moreover, when factors that may be influenced by human activities are involved, the thresholds could be used to set environmental standards for lake preservation. / La gestion des plans d'eau nécessite la définition de seuils physico-chimiques pour la préservation ou la restauration des écosystèmes. Selon la Directive Cadre européenne sur l'Eau, les limites de classes de qualité physico-chimiques doivent être fixées en cohérence avec les éléments de qualité biologique.Une façon de faire consiste à analyser les réponses des communautés aquatiques aux gradients environnementaux formés par les sites de monitoring et d'identifier des seuils écologiques de communautés, c'est-à-dire des zones dans les gradients où le turnover des espèces est le plus important. Dans cette étude, les données de pêches provenant de 196 plans d'eau ont été considérées pour rechercher des seuils écologiques avec la méthode de gradient forest. L'analyse a porté sur 25 espèces avec 36 paramètres environnementaux. Les résultats ont révélé que la température maximale était le facteur le plus important dans la distribution des espèces de poissons. Les autres paramètres importants étaient les facteurs géographiques, la concentration en carbone organique dissous et la transparence de l'eau alors que les nutriments semblaient avoir peu d'influence. Malgré la diversité de réponses des espèces aux gradients, des seuils de communautés ont été détectés dans les gradients des paramètres physico-chimiques les plus importants ainsi que dans ceux des concentrations en phosphore total et en nitrates. Les seuils identifiés dans une telle étude macroécologique peuvent faire apparaître de nouveaux patrons de distribution naturelle des poissons et améliorer la caractérisation des niches spécifiques. De plus, quand des facteurs influencés par les activités humaines sont impliqués, ces seuils pourraient être utilisés pour fixer des limites pour la protection des plans d'eau.