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Chlorinated paraffins (CPs) are high-volume chemicals used in numerous industrial applications. Their quantitative analysis is extremely challenging and this work presents the optimization of an analytical method based on gas chromatography hyphenated with electron capture negative ionization time-offlight high-resolution mass spectrometry (GC-ECNI-TOF HRMS) for the simultaneous determination of short-chain and medium-chain CPs (SCCPs and MCCPs, respectively) in fish tissues (i.e. dorsal muscle). The resolution of the TOF-MS analyzer reduced or eliminated isobaric interferences and the CP response was optimized through Design of Experiment. A simple clean-up procedure based on adsorption chromatography further removed some potentially interfering organochlorines. Good selectivity, linearity and accuracy were achieved; method detection limits or limits of reporting were compatible with expected levels in wild fish (0.03-0.35 ng g-1 wet weight, ww, depending on the congener). This method was proven suitable for the analysis of CPs in tissues of common barbel Barbus, a fish species frequently used for water quality monitoring purposes in Europe. SCCPs and MCCPs were found to be widespread within the Rhône river basin (France). At all locations, MCCP concentrations (1.3-72.7 ng g-1 ww) were higher than those of SCCPs (0.3-10.6 ng g-1 ww) and levels were systematically lower than the proposed Probable No Effect Concentrations (PNEC). Spatial variations of SCCP composition profiles largely surpassed those of MCCPs, suggesting the influence of local sources.

/ Une enquête nationale a été lancée pour améliorer nos connaissances des pratiques de gestion piscicole en milieux lacustres afin de mieux comprendre, à terme, le rôle de cette gestion dans la structure des peuplements observés. Ces résultats révèlent le dynamisme des structures de gestion, qu'il s'agisse des Fédérations ou des Associations de pêche, soucieuses à la fois de satisfaire les pêcheurs et de préserver ou améliorer la qualité des milieux aquatiques lentiques. Ces structures interviennent sur un grand nombre de sites, de différentes taille et origine, et mettent en oeuvre diverses actions sur les peuplements et les milieux. Les pratiques de gestion, différentes selon le type de milieu considéré, semblent toutefois avoir assez peu évolué, les déversements d'espèces demeurent l'action de gestion la plus fréquente et les espèces manipulées sont les mêmes qu'il y a 20 ans. Néanmoins, il semblerait qu'une évolution des pratiques soit en marche, l'idée d'un passage à une gestion patrimoniale, bien que très marginale aujourd'hui, semblant peu à peu faire son chemin. Malgré l'amélioration des connaissances sur les plans d'eau liée à la mise en place des réseaux de surveillance ou de contrôle opérationnel prévus par la DCE, les gestionnaires semblent toujours confrontés à un manque de connaissances qui porte préjudice à la gestion. Des inventaires supplémentaires, des études ainsi que des suivis de prélèvements sont directement entrepris par ces derniers, sans que cela ne se traduise toutefois par la prise de mesure particulière. Cela suggère une difficulté dans la traduction opérationnelle des informations collectées.

Based on a workshop organised by the Atlantic Salmon Trust, held in Edinburgh Tuesday, 6th November – Thursday, 8th November 2017.; International audience

Diagnosing impacts of streams fragmentation on fish is crucial in order to efficiently restore ecological continuity and to make blue infrastructure functional again. Using biotelemetry tools is a method to determine if fish could pass obstacles (e.g. dams, weirs) occurring across streams and finally assess restoration efficacy. A case study is presented concerning survey of brown trout populations inhabiting fragmented small headwater streams in Ile de France region. / Pour que la trame bleue soit fonctionnelle, il est important de diagnostiquer l'effet de la fragmentation des cours d'eau sur les poissons pour restaurer de manière efficace la continuité écologique. Une méthode consiste à utiliser les outils de biotélémétrie pour identifier la capacité des poissons à franchir les ouvrages existants et leurs aménagements et évaluer ainsi l'efficacité de la restauration. Un cas d'étude est présenté concernant le suivi de populations de truite dans des petits cours d'eau de têtes de bassins en Ile-de-France.

/ Compte tenu de l'effort d'amélioration de la continuité écologique dans le bassin de la Seine, il s'avère important d'essayer de quantifier les conséquences de différents scenarios d'aménagements de l'estuaire pour les poissons estuariens et migrateurs. Dans ce contexte, le projet ANACONDHA s'intéresse à la connectivité fonctionnelle de l'estuaire de la Seine et à la capacité des différentes espèces de poissons d'y réaliser une partie ou l'ensemble de leur cycle de vie. Les objectifs sont (1) de tester une approche de modélisation géomatique de la connectivité fonctionnelle et (2) d'évaluer sa capacité à fournir une analyse cartographique des potentialités de préservation et de réhabilitation des habitats estuariens. Après un bilan bibliographique et une consultation de 15 experts comptant des chercheurs, des acteurs régionaux et des acteurs locaux, 6 espèces avec des cycles de vie contrastés et présentant des enjeux différents au sein de l'estuaire ont été sélectionnées comme candidates pour modéliser la connectivité fonctionnelle : le bar commun, la truite de mer, l'anguille européenne, le mulet porc, le flet et la brème commune. Considérant la disponibilité des données géomatiques, la liste des espèces candidates et les avis des experts en termes des priorités régionales, le choix a été fait de se concentrer dans les modélisations sur deux cas d'étude contrastés : 1) les migrations tidales des juvéniles du bar commun vers les nourriceries et les habitats de refuge au cours d'une marée et 2) les migrations des adultes de truite commune (forme rivière et mer) vers les frayères. Ces choix ont permis de tester l'approche de modélisation géomatique de la connectivité (outil ANAQUALAND) sur des cas qui impliquent des étendues spatiales (embouchure versus tout l'estuaire avec les affluents) et des échelles temporelles (un cycle de la marée versus une période de plusieurs mois) très différentes. Le travail réalisé offre une ouverture importante sur le sujet avec la possibilité d'aborder des questions concernant les traits biologiques des espèces en lien avec leur mobilité et de tester des hypothèses qui sont difficilement testables expérimentalement sur de grands milieux dynamiques comme l'estuaire de la Seine.

Functional trait theory provides a mechanistic framework to understand change in community composition and community assembly through time and space. Despite this, trait-based approaches have seldom been used in ecological restoration. Succession theory predicts that habitat complexity and resource availability will increase with restoration time, leading to increased functional dissimilarity among coexisting species. However, in the case of tidal marsh restoration, it is not clear whether reestablishing the harsh abiotic conditions typical of estuaries will initiate successional trajectories. We investigated monotonic changes in the functional structure of fish communities and shifts in assembly mechanisms, with tidal restoration time. A five-level gradient of 'intertidal habitat naturalness' was constructed from a set of artificialized (dyked), restored (with different ages) and natural intertidal sites, and used as a surrogate for restoration progress. The fish ecophases were described using ten functional traits related to food acquisition and swimming ability. The trends in six functional dimensions (identity, richness, evenness, dispersion, originality and specialization) were investigated along the naturalness gradient. Consistenly with succession theory, functional specialization, dispersion and, less markedly, richness increased with intertidal naturalness meaning that restored and natural intertidal habitats supplied fish with specific foraging and dwelling conditions absent from dyked marshes. Community assembly patterns varied with respect to traits and differed at both ends of the naturalness gradient. Dyked marshes were more affected by trait convergence possibly due to limiting resources. Environmental filtering was detected all along the naturalness gradient although the traits affected varied depending on the naturalness level of habitats. Environmental filtering tended to decrease in restored and natural intertidal habitats. Increased naturalness restored the attractivity of benthic habitats as feeding or settling grounds, promoted shelter-seeking vs. free-swimming strategists and favoured ecophases with carnivorous diets, feeding on microinvertebrates and benthic low-mobility macroinvertebrates. Approaches based on functional trait diversity have the potential to question and refine the theoretical frame of ecological restoration and to assist managers in their efforts to restore tidal wetlands.test

/ Le contrôle de surveillance doit permettre de récolter les données nécessaires pour évaluer l'état écologique de chaque masse d'eau sélectionnée, via l'utilisation de métriques basées sur le peuplement de poisson, en lui attribuant une note de qualité. La réalisation récurrente de ce contrôle standardisé doit également permettre d'interpréter les modifications et évolutions de ces peuplements résultant d'incidences naturelles et/ou anthropiques. Les résultats du contrôle de surveillance serviront ensuite au rapportage européen en 2015. Ce rapport présente, les résultats des campagnes de contrôle de surveillance 2016, une description de la méthodologie et des premiers résultats des campagnes.

Dechlorane related compounds (DRCs), including Dechlorane Plus (syn-DP and anti-DP), Dechlorane-601,-602, -603 and Chlordene Plus (CP), constitute a group of polychlorinated flame retardants (FRs) that are still of industrial use. In particular, DRCs have been detected in various nvironmental matrices and in different aquatic and terrestrial biota, thus exhibiting bioaccumulation and biomagnification potentials. The present study aimed at producing first occurrence data of a range of DRCs in Silurus spp. samples from different rivers located in France. Determination was carried out by gas chromatography high-resolution mass spectrometry after a sample clean-up based on a multilayer silica column and gel permeation chromatography. The concentration of monitored SDRCs ranged from 1.58 to 408 pg.g-1 wet weight (54 - 11100 pg.g-1 lipid weight). The fractional abundance of syn- and anti-DP stereoisomers was similar to that reported by other studies with an average equal to 0.60. Dec-601 was not detected in any sample. Detection frequencies ranged between 34 and 100% for other DRCs. Investigated correlations between DRCs and polychlorobiphenyls (PCBs) suggest a link with lipid content but independent contamination sources.

Lakes in Europe are subject to multiple anthropogenic pressures, such as eutrophication, habitat degradation and introduction of alien species, which are frequently inter-related. Therefore, effective assessment methods addressing multiple pressures are needed. In addition, these systems have to be harmonised (i.e. intercalibrated) to achieve common management objectives across Europe. Assessments of fish communities inform environmental policies on ecological conditions integrating the impacts of multiple pressures. However, the challenge is to ensure consistency in ecological assessments through time, across ecosystem types and across jurisdictional boundaries. To overcome the serious comparability issues between national assessment systems in Europe, a total anthropogenic pressure intensity (TAPI) index was developed as a weighted combination of the most common pressures in European lakes that is validated against 10 national fish-based water quality assessment systems using data from 556 lakes. Multi-pressure indices showed significantly higher correlations with fish indices than single-pressure indices. The best-performing index combines eutrophication, hydromorphological alterations and human use intensity of lakes. For specific lake types also biological pressures may constitute an important additional pressure. The best-performing index showed a strong correlation with eight national fish-based assessment systems. This index can be used in lake management for assessing total anthropogenic pressure on lake ecosystems and creates a benchmark for comparison of fish assessments independent of fish community composition, size structure and fishing-gear. JRC.D.2-Water and Marine Resources