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/ Une enquête nationale a été lancée pour améliorer nos connaissances des pratiques de gestion piscicole en milieux lacustres afin de mieux comprendre, à terme, le rôle de cette gestion dans la structure des peuplements observés. Ces résultats révèlent le dynamisme des structures de gestion, qu'il s'agisse des Fédérations ou des Associations de pêche, soucieuses à la fois de satisfaire les pêcheurs et de préserver ou améliorer la qualité des milieux aquatiques lentiques. Ces structures interviennent sur un grand nombre de sites, de différentes taille et origine, et mettent en oeuvre diverses actions sur les peuplements et les milieux. Les pratiques de gestion, différentes selon le type de milieu considéré, semblent toutefois avoir assez peu évolué, les déversements d'espèces demeurent l'action de gestion la plus fréquente et les espèces manipulées sont les mêmes qu'il y a 20 ans. Néanmoins, il semblerait qu'une évolution des pratiques soit en marche, l'idée d'un passage à une gestion patrimoniale, bien que très marginale aujourd'hui, semblant peu à peu faire son chemin. Malgré l'amélioration des connaissances sur les plans d'eau liée à la mise en place des réseaux de surveillance ou de contrôle opérationnel prévus par la DCE, les gestionnaires semblent toujours confrontés à un manque de connaissances qui porte préjudice à la gestion. Des inventaires supplémentaires, des études ainsi que des suivis de prélèvements sont directement entrepris par ces derniers, sans que cela ne se traduise toutefois par la prise de mesure particulière. Cela suggère une difficulté dans la traduction opérationnelle des informations collectées.

Diagnosing impacts of streams fragmentation on fish is crucial in order to efficiently restore ecological continuity and to make blue infrastructure functional again. Using biotelemetry tools is a method to determine if fish could pass obstacles (e.g. dams, weirs) occurring across streams and finally assess restoration efficacy. A case study is presented concerning survey of brown trout populations inhabiting fragmented small headwater streams in Ile de France region. / Pour que la trame bleue soit fonctionnelle, il est important de diagnostiquer l'effet de la fragmentation des cours d'eau sur les poissons pour restaurer de manière efficace la continuité écologique. Une méthode consiste à utiliser les outils de biotélémétrie pour identifier la capacité des poissons à franchir les ouvrages existants et leurs aménagements et évaluer ainsi l'efficacité de la restauration. Un cas d'étude est présenté concernant le suivi de populations de truite dans des petits cours d'eau de têtes de bassins en Ile-de-France.

/ Compte tenu de l'effort d'amélioration de la continuité écologique dans le bassin de la Seine, il s'avère important d'essayer de quantifier les conséquences de différents scenarios d'aménagements de l'estuaire pour les poissons estuariens et migrateurs. Dans ce contexte, le projet ANACONDHA s'intéresse à la connectivité fonctionnelle de l'estuaire de la Seine et à la capacité des différentes espèces de poissons d'y réaliser une partie ou l'ensemble de leur cycle de vie. Les objectifs sont (1) de tester une approche de modélisation géomatique de la connectivité fonctionnelle et (2) d'évaluer sa capacité à fournir une analyse cartographique des potentialités de préservation et de réhabilitation des habitats estuariens. Après un bilan bibliographique et une consultation de 15 experts comptant des chercheurs, des acteurs régionaux et des acteurs locaux, 6 espèces avec des cycles de vie contrastés et présentant des enjeux différents au sein de l'estuaire ont été sélectionnées comme candidates pour modéliser la connectivité fonctionnelle : le bar commun, la truite de mer, l'anguille européenne, le mulet porc, le flet et la brème commune. Considérant la disponibilité des données géomatiques, la liste des espèces candidates et les avis des experts en termes des priorités régionales, le choix a été fait de se concentrer dans les modélisations sur deux cas d'étude contrastés : 1) les migrations tidales des juvéniles du bar commun vers les nourriceries et les habitats de refuge au cours d'une marée et 2) les migrations des adultes de truite commune (forme rivière et mer) vers les frayères. Ces choix ont permis de tester l'approche de modélisation géomatique de la connectivité (outil ANAQUALAND) sur des cas qui impliquent des étendues spatiales (embouchure versus tout l'estuaire avec les affluents) et des échelles temporelles (un cycle de la marée versus une période de plusieurs mois) très différentes. Le travail réalisé offre une ouverture importante sur le sujet avec la possibilité d'aborder des questions concernant les traits biologiques des espèces en lien avec leur mobilité et de tester des hypothèses qui sont difficilement testables expérimentalement sur de grands milieux dynamiques comme l'estuaire de la Seine.

/ Le contrôle de surveillance doit permettre de récolter les données nécessaires pour évaluer l'état écologique de chaque masse d'eau sélectionnée, via l'utilisation de métriques basées sur le peuplement de poisson, en lui attribuant une note de qualité. La réalisation récurrente de ce contrôle standardisé doit également permettre d'interpréter les modifications et évolutions de ces peuplements résultant d'incidences naturelles et/ou anthropiques. Les résultats du contrôle de surveillance serviront ensuite au rapportage européen en 2015. Ce rapport présente, les résultats des campagnes de contrôle de surveillance 2016, une description de la méthodologie et des premiers résultats des campagnes.

/ Dans cette étude, nous avons comparé l'évolution de trois grandes villes,

/ Ce protocole décrit la mesure de l'activité enzymatique EROD (Ethoxy-Résorufine-O-Déethylase) sur fraction post-mitochondriale (S9) d'homogénat de foie de poisson par une méthode fluorimétrique sur microplaque 96 puits. Cette mesure peut être réalisée à partir d'homogénats de foies de poissons pêchés sur le terrain ou exposés en laboratoire à des effluents ou des substances. Elle permet le diagnostic de l'exposition des poissons à des inducteurs du système CYP1A. La méthode utilisée est adaptée de la norme AFNOR NFT 90-385 (sept. 2001).

/ Le stockage de l'eau a considérablement augmenté dans le monde depuis les années 1950. Les retenues collectent et stockent l'eau, pour l'alimentation des villes en eau potable, à des fins agricoles, industrielles, piscicoles, de loisir ou de soutien d'étiage. En France, les retenues de petites tailles se sont multipliées à la fin du 20ième siècle. Au début des années 2000, on en comptait environ 125 000. La création de nouveaux ouvrages de stockage se poursuit, parallèlement à une recherche de réduction des usages de l'eau. Ces créations soulèvent de nombreuses questions environnementales, notamment en termes d'impact sur le milieu aquatique, en particulier dans les zones déjà très équipées et où les ressources en eau sont d'ores et déjà très mobilisées. La construction d'une nouvelle retenue nécessite réglementairement une déclaration ou la sollicitation d'une autorisation auprès des services de l'Etat, impliquant de réaliser une étude d'impact environnemental du projet. Une telle étude doit dorénavant évaluer les effets cumulés avec d'autres projets équivalents. Cette dimension « cumulée » de l'impact d'ouvrages de stockage d'eau sur un même bassin versant est souvent mal appréhendée, les connaissances et les méthodologies étant peu développées sur cet aspect. Bureaux d'étude et services de l'Etat font ainsi face à un manque d'outils opérationnels leur permettant d'instruire les projets de nouvelles retenues. Ces difficultés en entrainent d'autres au niveau de la planification de la gestion de l'eau et de l'encadrement à la création de telles retenues. Dans ce contexte, le Ministère de l'Environnement, de l'Energie et de la Mer (MEEM), avec l'appui de l'Onema, a sollicité une expertise scientifique collective (ESCo) auprès d'Irstea, en partenariat avec l'Inra, sur l'impact cumulé des retenues d'eau sur le milieu aquatique. Cette ESCo a mobilisé une quinzaine d'experts de différents organismes de recherche et de disciplines variées. Cette ESCo s'est fondée sur l'analyse d'un millier d'articles scientifiques et de rapports internationaux.

/ La présente instruction décrit la préparation et le déroulement d'une campagne de pêche scientifique accompagnée des opérations de prélèvements in situ d'échantillons biologiques sur des poissons de l'espèce chevaine (Leuciscus cephalus). Cette procédure a été établie pour la réalisation des campagnes de terrain d'un programme de recherche interdisciplinaire chargé d'évaluer l'impact des perturbateurs endocriniens sur les milieux aquatiques (SURVAQUA-PNRPE). Elle peut néanmoins être appliquée à d'autres études du même type qui prendraient en compte tout ou partie partie des biomarqueurs présentés. A noter que le programme SURVAQUA comprenait un volet « chimie » dont les procédures d'échantillonnage (eau, sédiment) ne sont pas décrites dans ce protocole.

/ Cette méthode décrit la mesure in vivo, par détection fluorimétrique dans un milieu d'essai d'un efflux issu d'une activité de bio transformation de pro-larves de poissons zèbre exposées à de l'éthoxyrésorufine. Cette activité de biotransformation, est une activité EROD (Ethoxy-Resorufine-O-Dééthylase) mesurée en réponse à une exposition préalable des organismes à un échantillon ou une substance susceptible de moduler cette activité. Le présent protocole comprend donc la phase d'exposition préalable selon un protocole standard suivi de la phase de mesure de l'activité EROD par efflux.

/ Ce rapport comprend quatre parties : - une présentation générale du bassin de la Gironde - un suivi expérimental de la petite faune circulante (poissons, crevettes) aux abords du Centre Nucléaire de Production d'Electricité du Blayais - les résultats du suivi des captures professionnelles 2015 dans l'ensemble de l'estuaire - une synthèse et conclusion générale.